IDENTIFIKASI BAKTERI DI UDARA RUANG PERAWATAN INTENSIF RUMAH SAKIT WAHIDIN SUDIROHUSODO DENGAN UNIVERSAL PRIMER DAN SEKUENSING

ABSTRAK
ARNIATI SAMAILA. Identifikasi Bakteri di Udara Ruang Perawatan Intensif
Rumah Sakit Wahidin Sudirohusodo dengan Universal Primer dan Sekuensing
(dibimbing oleh Nasrum Massi dan Rizalinda Sjahril.
Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi bakteri di ruang perawatan
intensif (ICU, CVCU, PICU, dan NICU) Rumah Sakit Wahidin Sudirohusodo.
Metode yang digunakan dalam penelitian yaitu kultur, PCR, dan
sekuensing. Identifikasi bakteri melalui kultur menggunakan media selektif dan
pengujian biokimia. PCR universal primer 16S rRNA digunakan untuk
mengamplifikasi DNA bakteri dan produknya yang berukuran 150 bp
disekuensing dan dianalisis dengan program BLAST.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa melalui hasil kultur didapatkan 6
genus bakteri yaitu Staphylococcus, Bacillus, Acinetobacter, Alkaligenes,
Enterobacter, dan Escherichia. Hasil sekuensing berupa sekuen 146 basa.
Analisis menggunakan program BLAST pada database GenBank didapatkan 21
genus yaitu Staphylococcus, Burkholderia, Achromatium, Alcaligenes,
Georgfuchsia, Denitratisoma, Acinetobacter, Bacillus, Paenibacillus, Alpha,
Afipia, Leuconostoc, Rhodopseudomonas, Alkanindiges, Mesorhizobium,
Brevundimonas, Pseudaminobacter, Sporosarcina, Clostridium, Bradyrhizobium,
dan Caulobacter. Perbandingan hasil identifikasi kultur dan sekuensing adalah
36 %. Kesimpulan penelitian ini adalah identifikasi kultur didapatkan 6 genus dan
sekuensing didapatkan 21 genus.