Tinjauan Literatur Dan Docking Beberapa Antivirus Bahan Alam Sebagai Kandidat Obat COVID-19 = Literatur Review and Docking of Several Antivirals as COVID-19 Drug Candidates

DEPI DAMAYANTI. Tinjauan Literatur Dan Docking Beberapa Antivirus Bahan Alam Sebagai Kandidat Obat COVID-19 (dibimbing oleh Yusnita Rifai dan Muh Nur Amir)
Penyakit infeksi merupakan salah satu penyebab utama morbiditas dan mortalitas di seluruh dunia. Baru-baru ini COVID-19 menjadi penyakit menular utama yang telah merenggut banyak nyawa manusia di dunia dan dinyatakan sebagai sebuah pandemi. Dalam usaha penanggulangan COVID-19 beberapa obat telah digunakan untuk menyembuhkan pasien COVID-19, namun obat-obatan tersebut memiliki efek samping yang berbahaya dan tingkat toksisitas yang tinggi bagi pasien sehingga beberapa obat-obatan tersebut tidak direkomendasikan dan harus digunakan secara eksperimental. Saat ini, berbagai senyawa bahan alam sedang dieksplorasi secara ekstensif sebagai kandidat obat COVID-19. Terdapat banyak penelitian telah membuktikan komponen senyawa tanaman dapat melawan penyakit yang disebabkan oleh infeksi virus. Penelitian ini bertujuan untuk mencari kandidat obat dari senyawa bahan alam yang bersifat sebagai antivirus dan memiliki peluang untuk pengobatan COVID-19. Pencarian kandidat obat dilakukan dengan memanfaatkan tinjauan literatur dan metode in silico berupa molecular docking terhadap senyawa antivirus bahan alam yang memilki potensi sebagai kandidat obat COVID-19 untuk pengembangan dan desain obat baru. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebanyak 20 senyawa antivirus bahan alam dari berbagai golongan senyawa menunjukkan potensinya sebagai kandidat obat COVID-19 dengan target yang berbeda-beda terhadap virus SARS-CoV-2. Pada hasil pengujian simulasi molecular docking diperoleh afinitas senyawa antivirus bahan alam yaitu senyawa Nimbin dan Sinigrin dengan afinitas yang sangat mendekati native ligand yaitu-6.7 dan -6.5, senyawa ginkgetin memilki potensi yang paling kuat dengan afinitas -9.9, senyawa Eleutheroside B1, Andrographolide, Epigallocatechin gallate, Curcumin, Emodin, Kuersetin, Piperine, Alpha Mangostin, isoliquiritigenin, Myricetin, Quinine, Diphyllin, Biochanin A, dan Xanthorrhizol yang secara berturut turut memiliki afinitas -7.2, -6.8, -8.2, -7.1, -7.2, -7.4, -7.0, -7.1, -7.7, -7.4,-7.0, -7.6, -7.1, dan -7.2, yang berarti memiliki potensi sebagai kandidat obat COVID-19. Hasil perbandingan visualisasi struktur senyawa bahan alam dengan native ligand menunjukkan kemiripan ikatan interaksi yang identik pada sisi aktif Main Protease yang memiliki pengaruh pada Mpro COVID-19.
Kata Kunci: Bahan Alam, Antivirus, Molecular Docking, Main Protease (Mpro) COVID-19, COVID-19