Keragaman Genetik Berdasarkan Analisis Penanda Daerah D-Loop pada Kambing Marica dan Kambing Kacang

Sulawesi Selatan memiliki jenis kambing lokal yaitu kambing Kacang dan kambing Marica. Selama ini masyarakat beranggapan bahwa kedua kambing tersebut merupakan jenis kambing yang dianggap sama meskipun secara morfologinya terlihat berbeda namun belum dapat diketahui perbedaan atau persamaannya. Adanya dugaan keterkaitan / hubungan kekerabatan antara kambing Kacang dan kambing Marica menjadi hal penting untuk diketaui. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui keragaman genetik kambing Marica dan kambing Kacang berdasarkan analisis penanda daerah D-loop, dengan melihat komposisi nukleotida, jarak genetik, dan pohon filogeni. Materi penelitian yaitu 116 sampel darah kambing Marica dan Kacang yang dikoleksi dari Maros dan Jeneponto dan yang berhasil terkualifikasi jumlahnya 21 sampel yang dapat dianalisis. Tahapan penelitian meliputi ekstraksi DNA, PCR, elektroforesis dan sequencing DNA. Primer forward (5’-TCA CTA TCA GCA CCC AAA GC-3’) dan reverse (5’-GGC ATT TTC AGT GCC TTG CT-3’) digunakan pada proses PCR. Hasil sekuensing dianalisis dalam program MEGA 6.0. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kambing Kacang dan kambing Marica menunjukkan kecendrungan berada pada satu rumpun didasarkan pada hasil analisis daerah D-loop untuk komposisi nukleotida, rataan frekuensi, rataan jarak genetik dan pohon filogeni.