ISOLASI DAN KARAKTERISASI GEN PENYANDI PROTEIN STRUKTURAL VP24 White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada UDANG WINDU (Penaeus monodon Fabricus, 1798)

ABSTRAK
RIANA ANDANG DEWI. L22108258. Isolasi dan Karakterisasi Gen Penyandi
Protein Struktural VP24 White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada Udang Windu
(Penaeus monodon Fabricius, 1798). Di bawah bimbingan Asmi Citra Malina
sebagai pembimbing utama dan Bunga Rante Tampangallo sebagai
pembimbing anggota.
WSSV merupakan patogen yang telah menghancurkan industri udang windu di
berbagai Negara termasuk Indonesia. Isolasi dan karakterisasi gen penyandi
protein struktural VP24 WSSV merupakan gen yang mengkode salah satu sifat
dari protein struktural mayor yang berada di intermedit virus. Tujuan dari
penelitian ini untuk mengkarakteristik gen penyandi protein struktural VP24
WSSV yang diisolasi dari udang windu, Penaeus monodon. Perlu diketahui
penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret sampai Mei 2013 di Laboratorium
Bioteknologi Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Payau (BPPBAP)
Maros, Sulawesi Selatan. Genom DNA WSSV diisolasi dari kaki renang dan kaki
jalan udang windu yang dipelihara di Tambak Takalar dengan menggunakan
metode ekstraksi DTAB-CTAB (Dodecyl Hexadecyl Trimetgyl Ammonium
Bromide - Cationic Hexadecyl Trimetgyl Ammonium Bromide). Gen tersebut
diisolasi dengan menggunakan mesin Polymerase Chain Reaction (PCR) dan
dilanjutnya proses sekuensing. Data yang dihasilkan dianalisis dengan
menggunakan program Genetyx Versi 7 dan basic local alignment search tool
(BLAST). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen penyandi VP24 WSSV
berhasil diisolasi dari udang windu asal Takalar memiliki panjang sekuen sekitar
627 bp yang mengkodekan 215 asam amino. BLAST-N menunjukkan tingkat
similaritas yang identik (99%) antara gen VP24 asal Indonesia dengan gen VP24
asal Negara Meksiko yang ada di data base Bank Gen. Maka dapat disimpulkan
bahwa fragmen DNA hasil amplifikasi PCR tersebut merupakan sekuens gen
penyandi protein struktural VP24 WSSV. Gen ini diyakini mampu mengkode
karakter penting penyakit WSSV yang utama yaitu VP24.
Kata kunci: Udang Windu, Penyakit, WSSV, isolasi, karakterisasi, gen VP24
WSSV