Polimorfisme Gen Rv1196 dan Rv0125 Mycobacterium Tuberculosis sebagai Pengkode Antigen Kandidat Vaksin dari Isolat Tersimpan di Laboratorium Rumah Sakit Pendidikan Universitas Hasanuddin Makassar = Polymorphism of Rv1196 And Rv0125 Genes of Mycobacterium Tuberculosis as Encoding Vaccine Candidate Antigens from Stored Isolates in The Laboratory of Hasanuddin University Teaching Hospital Makassar

Latar Belakang: Tuberkulosis (TB) masih menjadi tantangan kesehatan global yang signifikan yang disebabkan oleh infeksi Mycobacterium tuberculosis. Meskipun telah tersedia vaksin Bacille Calmette-Guérin (BCG), efektivitasnya yang terbatas terhadap TB paru pada orang dewasa telah mendorong kebutuhan mendesak akan pengembangan kandidat vaksin yang lebih efektif. Pendekatan yang menjanjikan terletak pada pengembangan vaksin subunit, khususnya kandidat M72/AS01E, yang menggabungkan dua antigen protein penting: PPE18 dan PepA, yang masing-masing dikodekan oleh gen Rv1196 dan Rv0125. Metode: Penelitian ini menggunakan desain cross-sectional untuk menilai polimorfisme genetik gen Rv1196 (PPE18) dan Rv0125 (PepA) pada berbagai isolat klinis, dengan tujuan memahami keragaman genetik yang mungkin mempengaruhi efektivitas vaksin. Sebanyak 108 isolat M. tuberculosis yang tersimpan dari Laboratorium Rumah Sakit Pendidikan Universitas Hasanuddin di Makassar diamplifikasi menggunakan metodologi PCR. Sampel DNA yang positif untuk gen PPE18 dan PepA menjalani sekuensing Sanger. Sekuens yang dihasilkan disejajarkan dengan sekuens referensi H37Rv yang tersedia di database NCBI. Identifikasi polimorfisme dan perubahan asam amino dianalisis menggunakan perangkat lunak UGENE dan BioEdit. Hubungan filogenetik dianalisa menggunakan MEGA versi 11.3.0. Hasil: Penelitian ini mengidentifikasi variasi genetik pada gen Rv0125 dan Rv1196 dari isolat Mycobacterium tuberculosis dari sampel klinis. Pada gen Rv0125, satu SNP nonsinonim (nsSNP) teridentifikasi pada satu dari 32 sampel yang dianalisis, mengakibatkan perubahan asam amino. Analisis gen Rv1196 menunjukkan keragaman genetik yang substansial, dengan 106 substitusi nukleotida teridentifikasi pada 24 dari 34 sampel yang dianalisis. Dari polimorfisme ini, 63 (59,4%) dikarakterisasi sebagai mutasi nonsinonim yang menyebabkan perubahan asam amino. Kesimpulan: Penelitian ini menunjukkan adanya polimorfisme pada gen Rv0125 dan Rv1196 di antara isolat Mycobacterium tuberculosis tersimpan di Laboratorium Rumah Sakit Universitas Hasanuddin di Makassar. Terutama, gen Rv1196 menunjukkan keragaman genetik yang substansial, dengan beberapa polimorfisme nonsinonim yang menyebabkan perubahan asam amino.

Keyword : Mycobacterium tuberculosis, gen Rv1196, gen Rv0125, polimorfisme, antigen kandidat vaksin.