Analisis Bioinformatik Virus Sars Cov-2 Berdasarkan Profil Mutasi Pada Pasien Covid-19 Di Sulawesi Selatan = BIOINFORMATICS ANALYSIS OF SARS COV-2 VIRUS BASED ON MUTATION PROFILES IN COVID-19 PATIENTS IN SOUTH SULAWESI

Handayani H. Analisis Bioinformatik Virus Sars Cov-2 Berdasarkan Profil Mutasi Pada Pasien Covid-19 Di Sulawesi Selatan (dibimbing oleh Muh. Nasrum Massi, Rizalinda Sjahril, Irawaty Djaharuddin). Pemantauan genomik SARS-CoV-2 sangat penting untuk memahami evolusi virus serta dampaknya terhadap transmisi, keparahan penyakit, dan efektivitas vaksin. Data dari wilayah timur Indonesia, khususnya Sulawesi Selatan, masih terbatas meskipun beban kasus COVID-19 cukup tinggi. Whole genome sequencing (WGS) dilakukan pada sampel pasien COVID-19 dari Makassar dan sekitarnya. Analisis bioinformatik digunakan untuk memetakan profil mutasi, menentukan garis keturunan, serta menyusun pohon filogenetik. Mutasi dikaji lebih lanjut terkait transmisibilitas, virulensi, dan potensi lolos dari imunitas. Analisis menunjukkan mutasi dominan pada gen Spike (S) seperti D614G, L452R, P681R, dan N501Y, serta pada gen Nucleocapsid (N) dan protein aksesoris. Mutasi ini berkaitan dengan peningkatan fitness virus dan penurunan kemampuan netralisasi. Analisis filogenetik memperlihatkan pergeseran dari varian Delta (B.1.617.2) menuju Omicron (BA.5.2, XBB.1), sejalan dengan tren global. Subvarian XBB.1 terdeteksi pertama kali di Sulawesi Selatan, menegaskan adanya diversifikasi lokal. Penelitian ini memberikan gambaran komprehensip pertama tentang genomik SARS COV2 di Sulawesi Selatan. Hasilnya menekankan perlunya surveilans genomik berkelanjutan untuk mendukung pembaruan vaksin dan strategi kesehatan masyarakat. Kata kunci: SARS-CoV-2, profil mutasi, whole genome sequencing, Sulawesi Selatan, Omicron.