IDENTIFIKASI ISOLAT BAKTERI ENDOSIMBION DARI CACING TANAH Lumbricus rubellus MENGGUNAKAN METODE GEN 16S rRNA

Endosimbion merupakan bentuk hubungan evolusioner yang biasanya melibatkan organisme prokariotik dan eukariotik. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi jenis bakteri endosimbion yang di peroleh dari cacing tanah Lumbricus rubellus dengan menggunakan metode analisis molekuler sekuensing gen 16S rRNA terlebih dahulu, pengamatan morfologi koloni, morfologi sel dan uji biokimia pada isolat bakteri emdosimbion tersebut. Identifikasi secara molekuler dimulai dari ekstraksi DNA, kemudian diamplifikasi dengan primer universal 16S rRNA (63F dan 1387R) menggunakan PCR, lalu dielektroforesis dan dilakukan sekuensing. Hasil sekuens gen dianalisis untuk pencarian homologi menggunakan program BLAST. Isolat F3 merupakan bakteri Gram-positif tunggal yang berbentuk batang, berwarna cream, permukaan koloni halus, berbentuk bulat, tepian rata, elevasi cembung, bersifat heterofermentatif katalase negatif, non motil. Hasil amplifikasi dengan PCR menunjukan amplikasi 1300 bp dari sekuens DNA gen 16S rRNA. Hasil analisis sekuens dari bakteri endosimbion isolat F3 menunjukan persen kemiripan yang tinggi (98.40%) dengan Bacillus velezensis. Hasil identifikasi tersebut menunjukan bahwaisolat F3 yang diisolasi dari cacing tanah Lumbricus rubellus merupakan Bacillus velezensis strain BvL03.
Kata Kunci: Identifikasi, Bakteri Endosimbion, Cacing Tanah Lumbricus rubellus, Gen 16S rRNA.