OPTIMASI SELEKSI MARKA DOMINAN DAN KODOMINAN Syzygium polycephalum UNTUK STUDI GENETIK = Optimization of Dominant and Codominant Marker Selection in Syzygium polycephalum for Genetic Studies

Latar belakang: Syzygium polycephalum merupakan tanaman endemik Indonesia yang memiliki potensi sebagai tanaman obat dan tumbuh secara alami di KHDTK Universitas Hasanuddin. Informasi genetik melalui seleksi primer molekuler sangat penting untuk studi genetik dan pengelolaan spesies ini secara optimal. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimasi seleksi marka dominan (RAPD dan ISSR) dan kodominan (SSR) pada S. polycephalum untuk studi genetik. Metode: Sampel daun dikoleksi dari 6 individu pohon dengan masing-masing 5 helai daun. Metode penelitian meliputi ekstraksi DNA menggunakan Plant Genomic DNA Mini Kit, uji kuantitas menggunakan Qubit 3.0 Fluorometer, seleksi 30 primer (20 RAPD, 5 ISSR, dan 5 SSR) melalui PCR, serta visualisasi hasil menggunakan elektroforesis gel agarose. Hasil: Hasil uji kuantitas menunjukkan konsentrasi DNA berkisar 3,6-28,1 ng/µl. 20 jenis primer RAPD yang diseleksi, tidak semuanya teramplifikasi. Primer RAPD jenis PLW04 tidak teramplifikasi, sementara 18 primer lainnya berhasil menghasilkan pita dengan tipe polimorfik, dan 1 primer menghasilkan pita monomorfik. 5 primer ISSR yang digunakan semuanya teramplifikasi dan menghasilkan pita polimorfik. Sedangkan untuk 5 primer SSR, hanya primer BPPAP_UH22 yang berhasil teramplifikasi dan menghasilkan pita polimorfik. Primer BPPAP_UH15 dan BPPAP_UH38 yang bersifat monomorfik dan dua lainnya tidak teramplifikasi. Kesimpulan: Dari 30 primer yang diseleksi, 18 primer RAPD (OPA11, PLR13, OPAD11, M147, M33, M29, PLD08, PLB10, OPAC12, OPK20, OPQ07, OPA02, OPD03, OPA09, OPP08, OPA15, OPZ05, OPG09), 5 primer ISSR (UBC868, UBC810, UBC827, UBC824, UBC813), dan 1 primer SSR (BPPAP_UH22) berhasil teramplifikasi dan menghasilkan pita polimorfik. Primer-primer optimal ini dapat digunakan sebagai informasi awal studi genetik S. polycephalum lebih lanjut guna mendukung program konservasi dan pengelolaan sumber daya genetik yang lebih efektif.