UJI SIMULASI MOLECULAR DYNAMIC DAN SITOTOKSISITAS EKSTRAK CHLORELLA VULGARIS TERHADAP REGENERASI TULANG

Latar Belakang : Tingkat osseointegrasi yang dihubungkan dengan marker tulang seperti meliputi osteopontin, osteokalsin, BMP-4, BMP-2, dan RUNX2 mengalami peningkatan pada proliferasi osteoblas di tahap awal osseointegrasi pada permukaan implan. Sebagai alternatif penggunaan bahan sintesis hidroksiapatit yang sering diaplikasikan dalam pengerjaan dental implan, biomaterial C. vulgaris yang telah diamati secara in vivo dibuktikan mampu menstimulasi pertumbuhan dan perkembangan fibroblast serta berifat antipreteolitik dan terbukti mempercepat pembentukan jaringan. Tujuan: Mengetahui dan menganalisi kestabilan interaksi kompleks senyawa aktif Chlorella vulgaris dan lima biomarker osteogenik meliputi osteopontin, osteokalsin, BMP-4, BMP-2, dan RUNX2 melalui uji simulasi molekular dinamik serta prediksi sifat fisikokimia dan prediksi sifat toksisitas senywa aktiv chlorella yang memiliki ikatan afinitas tertinggi dengan biomarker osteogenik. Metode: Simulasi dinamika molekul menggunakan perangkat lunak Gromacs v.2023.4. Prediksi sifat fisikokimia digunakan pkCSM online tool dan toksisitas senyawa melalui Protox online tool. Hasil: Analisis molecular dynamic dilakukan dengan analisis grafik RMSD (Root Mean Square Deviation), analisis grafik RMSF (Root Mean Square Fluctuation) dan analisis grafik RoG (Radius of gyration). Nilai RMSD ≤ 2Å menunjukkan dinamika molekul cukup stabil saat berikatan antara protein-ligan. Penilaian menggunakan Molecular Mechanics - Poisson Boltzmann Surface Area (MM-PBS) juga dilakukan untuk melihat nilai rata-rata ikatan energi bebas. Dari hasil penelitian semua senyawa berada dalam toksisitas kelas 4 menunjukkan toksisitas yang relatif rendah. Kesimpulan: Chlorella Vulgaris berpotensi menjadi kandidat senyawa regenerasi tulang dengan resiko toksisitas yang minimal berdasarkan hasil simulasi doking dan molekular dinamiknya.