IDENTIFIKASI ISOLAT BAKTERI PROBIOTIK DARI AYAM BURAS Gallus domesticus ASAL PESISIR KABUPATEN PANGKEP MENGGUNAKAN METODE GEN 16SrRNA

Probiotik ialah mikroorganisme hidup yang mampu memberikan manfaat bagi tubuh inangnya, dapat ditemukan pada saluran pencernaan dan termasuk dalam golongan Bakteri Asam Laktat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi isolat bakteri probiotik yang diperoleh dari saluran pencernaan Ayam Buras Gallus domesticus secara molekuler menggunakan primer PCR 63F dan 1387R dalam amplifikasi Gen 16SrRNA. Uji biokimia dilakukan untuk mengetahui sifat-sifat fisiologis koloni bakteri. Identifikasi secara molekuler (genotipik) dimulai dari ekstraksi DNA, kemudian diamplifikasi dengan primer universal 16SrRNA (63f dan 1387R) menggunakan PCR, lalu dielektroforesis dan dilakukan sekuensing dengan metode Sanger dideoxy. Hasil sekuens gen dinalisis untuk pencarian homologi menggunakan program BLAST. Hasil uji biokimia yakni koloni bersifat katalase negatif, non-motil, heterofermentatif. Hasil amplifikasi dengan PCR menunjukkan amplikon 1300 bp dari sekuens DNA gen 16SrRNA. Sedangkan hasil analisis sekuens dari bakteri probiotik isolat PaPJ menunjukkan persentase kemiripan yang tinggi (98.38%) dengan Enterococcus faecalis strain L1C1M8, sedangkan isolat PaPB menunjukkan persentase kemiripan (98.40%) dengan Enterococcus faecalis strain CE_18_3.