Identifikasi dan Analisis Variasi Genetik Interspesies Ikan Medaka Genus Oryzias Pada Danau Towuti Berdasarkan Kode Batang DNA = Identification and Analysis of Interspecies Genetic Variation of Medaka Fish of the Genus Oryzias in Lake Towuti Based on DNA Barcoding

Ikan medaka (genus Oryzias) merupakan salah satu ikan endemik yang diidentifikasi menghuni perairan Indonesia sehingga disebut homeland of Oryzias. Menurut IUCN populasi ikan medaka di Danau Towuti hampir terancam, sehingga diperlukan kajian secara genetik untuk menyajikan data agar tidak terjadi penurunan populasi. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengetahui variasi genetik interspesies ikan medaka dari Danau Towuti dengan DNA barcoding menggunakan gen COI. Sampel ikan medaka (n=12) didapatkan dari 3 statiun di Danau Towuti. Pada penelitian ini digunakan metode PCR dengan menggunakan primer COI FishF1 dan FishR1. Data yang diperoleh selanjutnya dianalisis menggunakan Bioedit, BLAST-N, Mega11, DnaSP, dan Network. Analisis data sekuens DNA gen COI dilakukan untuk mendapatkan konsensus sekuens, identifikasi spesies, variasi genetik, jarak genetik, pohon filogenetik, dan haplotype networking. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 12 sampel ikan medaka yang teridentifikasi dalam satu genus yaitu Oryzias dan terdiri dari 3 spesies yaitu O. marmoratus, O. profundicola, dan O. loxolepis. Variasi genetik interspesies menunjukkan nilai yang tinggi dengan haplotype diversity yaitu 0,95, nucleotide diversity rendah yaitu 0,021, dan 9 haplotipe. Rata-rata keseluruhan jarak genetik interspesies sebesar 0,020. Analisis filogenetik membentuk tiga klad. Haplotype network interspesies menunjukkan angka mutasi tertinggi yaitu 28 antara H8 dan H4, sedangkan angka mutasi terendah yaitu satu antara H8 dan H3. Informasi variasi genetik interspesies ikan medaka dari Danau Towuti dapat menjadi pertimbangan untuk konservasi genetik. Hasil yang diperoleh juga diharapkan dapat digunakan untuk menyusun DNA barcode library khususnya spesies O. profundicola dan O. loxolepis dari Danau Towuti.