Polimorfisme Genom Kloroplas pada Beberapa Famili Tanaman Kehutanan

Genom kloroplas merupakan pendekatan yang dilakukan dalam penggunaan marka molekuler untuk mengidentifikasi marka molekular melalui DNA barcode. Penanda genom kloroplas rbcL dan matK merupakan penanda yang umum direkomendasikan untuk analisis pada tumbuhan. Penelitian ini menggunakan penenda molekuler untuk mengidentifikasi famili tumbuhan yang dapat teramplifikasi pada primer Genom Kloroplas (matK dan rbcL) dengan proses PCR untuk memberi rekomendasi primer yang dapat digunakan untuk program konservasi genetik dan penggunaan plasma nutfah beberapa jenis famili tanaman yang lestari di Indonesia khususnya dan di dunia pada umumnya. DNA dari famili tumbuhan yang digunakan pada penelitian ini yaitu Euphorbiace pada tanaman kemiri, Arecaceae pada tumbuhan aren, Poaceae pada tumbuhan Bambu, Rubiaceae pada tumbuhan Jabon Merah, dan Dipterocarpaceae pada tanaman Rode. Hasil Study menunjukkan bahwa tingkat keberhasilan primer genom kloroplas pada penanda rbcL lebih tinggi dibandingkan dengan penanda matK. Primer genom kloroplas pada penanda matK dan rbcL yang mampu dijadikan rekomendasi untuk DNA barcode adalah matK 4, matK5, rbcL 1, rbcL 2, rbcL 3, dan rbcL 4 dengan masing-masing presentase sebesar 90%, 100%, 80%, 5%, 65%, dan 25%. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa primer universal yang digunakan dari Genom Kloroplas mampu mengidentifikasi kelima family tanaman pada penelitian ini. Oleh karena itu perlu dilakukan analisis sekuensing lebih lanjut dengan menggunakan penanda genetik matK dan rbcL yang telah teramplifikasi pada beberapa family lainnya yang teramplifikasi untuk memperkuat dan mendukung informasi dan identifikasi spesies secara morfologi.