KARAKTERISASI MORFOFISOLOGI DAN MOLEKULER BAKTERI PENYEBAB PENYAKIT BUSUK BULIR PADA TANAMAN PADI

Penyakit busuk bulir (Bacterial Grain Rot) yang disebabkan oleh
bakteri Burkholderia glumae menjadi ancaman yang serius bagi petani padi di Indonesia. Penelitian ini ditujukan untuk mengidentifikasi secara morfologi, fisiologi maupun molekuler isolat-isolat bakteri penyebab penyakit busuk bulir yang diperoleh dari beberapa lokasi pertanaman padi
di Sulawesi Selatan. Karakterisasi morfologi dilakukan dengan pengamatan makroskopis dari koloni bakteri yang ditumbuhkan pada media King’s B meliputi warna, bentuk, tepi, dan elevasi koloni. Karakterisasi fisiologi dilakukan dengan serangkaian uji yang dapat menunjukkan karakter khas dari B. glumae. Hasil karakterisasi morfofisiologi kemudian dikonfirmasi dengan analisa molekuler menggunakan primer spesifik B. glumae dan dilanjutkan dengan sekuensing. Data hasil sekuensing diolah menggunakan program BLAST dan dibandingkan dengan data pada NCBI untuk analisa filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 21 isolat yang diduga B. glumae menunjukkan warna koloni kuning, putih kekuningan, putih krem, dan putih keabuan, dengan bentuk koloni umumnya yang bulat, tepi halus, dan elevasi cembung. Seluruh isolat-isolat yang diuji berekasi positif pada KOH 3%, katalase, pigmen kuning toxoflavin, pencairan gelatin, dan uji pektinase pada bawang, sedangkan hasil negatif terlihat pada uji pembentukan pigmen fluorescens, koloni kuning pada media YDC, arginin dehidrolase, dan produksi levan. Hasil yang bervariasi terdapat pada uji oksidase fermentase, oksidase kovaks, dan uji hipersensitif pada daun
tembakau. Analisa molekuler menggunakan primer 1418S dan 1418A menghasilkan pita DNA pada ukuran ± 571 bp pada semua isolat yang diuji. Sekuensing 6 isolat yang mewakili lokasi dan varietas padi menunjukkan tingkat kemiripan sebesar 98-99% dengan isolat Burkholderia glumae yang telah terdaftar di GeneBank.