Deteksi Gen 4CL untuk Karakter Lignin dan Amplifikasi Primer InDels pada Kayu Kemiri (Aleurites moluccana)

Kayu kemiri (Aleurites moluccana) adalah salah satu jenis tanaman yang umumnya ditanam di hutan tanaman rakyat dan menjadi alternatif untuk memenuhi kebutuhan kayu masyarakat. Disisi lain, kayu tersebut memiliki kualitas yang rendah dan akan berpengaruh pada umur pakai kayu. Kayu kemiri tergolong kelas kuat IV dan kelas awet IV – V. Upaya yang dapat dilakukan untuk meningkatkan kualitas kayu adalah dengan melakukan inovasi dalam menyediakan bibit yang bagus, melakukan perawatan tanaman serta memberikan perlakuan pada kayu. Salah satu cara yang dapat dilakukan yaitu dengan melakukan tindakan deteksi dan aplikasi peningkatan lignin. Kadar lignin yang tinggi mampu memberikan tambahan serta meningkatkan kekuatan dan keawetan kayu. Diketahui beberapa induksi gen yang berkaitan dengan biosintesis lignin, seperti 4CL, PAL, C4H, F5H, CAD, dan CCR serta InDel sebagai penanda yang efektif melalui pendekatan teknik molekuler. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan gen 4CL dan amplifikasi primer InDel pada DNA kayu kemiri. Metode yang digunakan yaitu analisis molekuler dengan menggunakan KIT isolasi DNA Dneasy (Geneaid), pengujian kuantitas dan kualitas DNA serta amplifikasi primer. Hasil penelitian menunjukkan adanya pita yang teramplifikasi pada kombinasi primer 4CL 1 dan 4CL 3, InDel 1 serta InDel 3. Amplifikasi dari primer tersebut menghasilkan suhu annealing yang berkisar 54.7°C hingga 63.7°C sehingga dapat dilanjutkan untuk proses sekuensing.