Karakteristik Molekular dan Morfo-Genetik Populasi Karang Echinopora lamellosa (Esper, 1795) di Selat Alas, Provinsi Nusa Tenggara Barat = Molecular and Morpho-Genetic Characteristics of Coral Echinopora lamellosa (Esper, 1795) Population in Alas Strait, West Nusa Tenggara Province

MUHAMMAD IRSYAD ABIYUSFI GHAFARI. Karakteristik Molekular dan Morfo-Genetik Populasi Karang Echinopora lamellosa (Esper, 1795) di Selat Alas, Provinsi Nusa Tenggara Barat (dibimbing oleh Rosana Agus dan Magdalena Litaay).
Echinopora lamellosa merupakan jenis karang adaptif yang memiliki bioprospekting sebagai kandidat restorasi terumbu karang di wilayah Selat Alas, Provinsi Nusa Tenggara Barat. Penelitian ini merupakan penelitian awal yang bertujuan untuk (1) menganalisis keanekaragaman genetik, (2) keterkaitan karakteristik genetik dan morfologi intra– dan inter– populasi, dan (3) kekerabatan genetik populasi karang E. lamellosa di Selat Alas.
Penelitian ini mengambil sampel karang E. lamellosa dari Selat Alas utara dan selatan. Metode pengambilan data meliputi pengamatan dan pengukuran aspek morfologi dan morfometri, serta pengambilan data molekuler melalui teknik PCR-RAPD dan teknik DNA Barcoding. Data morfologi serta data molekuler digunakan untuk mengkonstruksi pohon fenetik NJ, tabel matriks jarak genetik dan aliran genetik, serta analisis AMOVA.
Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa keanekaragaman genetik intra populasi karang Echinopora lamellosa di Selat Alas tergolong tinggi (88%). Terdapat 2 (dua) populasi karang E. lamellosa yang berbeda secara signifikan berdasarkan konsensus pohon fenetik NJ dan hasil AMOVA (PhiPT=0.119, P<0.05 dan 0.01), dimana fitur morfologi yang lebih beragam dimiliki oleh populasi di Selat Alas utara yang hidup di tempat keruh. Jarak
genetik dan aliran gen antar sub-populasi mengikuti pola jarak habitat. Kekeruhan habitat, arus utama di Selat Alas dan peristiwa pemutihan karang diduga memainkan peranan penting dalam menentukan variasi karakteristik molekuler dan morfologi populasi E. lamellosa di Selat Alas.
Keywords : Adaptasi; Echinopora lamellosa; Karakterisitik Molekular; Karakteristik Morfologi; Karang Skleraktinia; Pemutihan Karang